ノンコーディング RNA とクロマチンの相互作用を網羅的に検出する系の開発

タンパクに翻訳されないRNAをnon-coding RNA（ノンコーディング/非コードRNA）と呼びます。現在、哺乳類ではクロマチンの約７０％が何らかのRNAに転写され、その内の半数以上がncRNAであると言われています。 ncRNAの多くは機能がわかっていません。機能が明らかなncRNAのうちクロマチンと相互作用し機能するものが報告されています。

クロマチンと相互作用するncRNAの機能を解析するために、私たちは最近RADICL-seq法と名付けた新しい方法を開発しました。RADICL-seq法はncRNAのみならず核内すべてのRNAとクロマチンの相互作用を網羅的に検出し、次世代シーケンサーを用いて解析できる画期的な方法です。私たちはRADICL-seq法を用いてこれまで明らかでなかったncRNAとクロマチンの相互作用やその機能の解析、およびさらにRADICL-seqをよくするための改良に取り組んでいます。